在臺灣，寵物骨灰撒河的合法性與申請流程有特定規範，且通常不建議或禁止任意在公共水域進行。根據現行法規，寵物遺體處理需遵循《廢棄物清理法》等相關規定，不可隨意掩埋、放水流或焚燒，以免影響環境與衛生，並可能面臨罰則。
寵物骨灰處理的合法方式
目前臺灣處理寵物骨灰的合法方式主要以火化為主，火化後的骨灰有多種環保葬選擇，但不包含任意撒河：
- 環保葬： 包含樹葬、植葬、灑葬、花葬、海葬及盆葬。這些方式都強調將骨灰回歸大自然，且多需在合法指定區域進行。
- 海葬： 雖然屬於環保葬的一種，但須將火化後的骨灰磨成細粉，裝入無毒且易分解的容器中，並投入各縣市政府規定的海域，且通常需要提前向縣市政府殯葬管理處申請核發海葬許可證明。 不可自行到海邊灑灰。
- 灑葬： 通常指在草地、花叢或其他自然植被位置將骨灰拋灑或淺埋，但仍需在指定位置進行申請。
指定水域與申請流程
目前臺灣並無普遍開放或指定寵物骨灰撒河（指在河川中撒骨灰）的特定水域。若考慮水葬，現行規定主要指向「海葬」，且需依照政府劃定的海域範圍及相關申請程序辦理。
以臺北市為例，雖設有寵物骨灰灑葬區「秘密花園」供民眾免費辦理灑葬，但這屬於陸地上的花圃灑葬區，而非河川水域。 其他縣市如臺中市，則有《臺中市寵物屍體處理及寵物生命紀念業管理自治條例》，規範寵物死亡需火化及骨灰安置方式。
總體而言，若欲進行寵物骨灰的水葬，應選擇合法的海葬服務，並向所在地縣市政府的殯葬管理處或相關單位諮詢，了解是否有指定的水域及完整的申請流程。自行將寵物骨灰撒入河中，可能違反《廢棄物清理法》等環保法規，導致罰款。
